Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxn3Q499D0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxn3Q499D0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxn3Q499D0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxn3Q499D0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxn3Q499D0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxn3Q499D0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxn3Q499D0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxn3Q499D0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxn3Q499D0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxn3Q499D0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxn3Q499D0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxn3Q499D0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxn3Q499D0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxn3Q499D0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxn3Q499D0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxn3Q499D0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Foxn3Q499D0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxn3Q499D0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxn3Q499D0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms