Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa20Q45VN2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defa20Q45VN2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Defa20Q45VN2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms