Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga1Q3V3R4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga1Q3V3R4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga1Q3V3R4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga1Q3V3R4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga1Q3V3R4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga1Q3V3R4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga1Q3V3R4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga1Q3V3R4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga1Q3V3R4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga1Q3V3R4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itga1Q3V3R4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga1Q3V3R4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms