Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm906Q3V0M1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm906Q3V0M1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm906Q3V0M1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms