Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bbof1Q3V079 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Bbof1Q3V079 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bbof1Q3V079 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms