Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BB287469Q3UT53 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BB287469Q3UT53 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BB287469Q3UT53 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BB287469Q3UT53 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BB287469Q3UT53 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BB287469Q3UT53 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms