Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Q3UPC7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q3UPC7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Q3UPC7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q3UPC7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q3UPC7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q3UPC7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3UPC7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q3UPC7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3UPC7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3UPC7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3UPC7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3UPC7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3UPC7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3UPC7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3UPC7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3UPC7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Q3UPC7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q3UPC7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms