Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrch2Q3UMG5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lrch2Q3UMG5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms