Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rmdn3Q3UJU9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rmdn3Q3UJU9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rmdn3Q3UJU9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms