Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ctu2Q3U308 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ctu2Q3U308 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctu2Q3U308 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ctu2Q3U308 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu2Q3U308 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu2Q3U308 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu2Q3U308 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu2Q3U308 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu2Q3U308 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu2Q3U308 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu2Q3U308 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctu2Q3U308 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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