Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cul4aQ3TCH7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cul4aQ3TCH7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cul4aQ3TCH7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cul4aQ3TCH7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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