Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ssrp1Q08943 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ssrp1Q08943 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ssrp1Q08943 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.4 ms