Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
MitfQ08874 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MitfQ08874 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MitfQ08874 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MitfQ08874 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MitfQ08874 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MitfQ08874 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MitfQ08874 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MitfQ08874 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MitfQ08874 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MitfQ08874 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MitfQ08874 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MitfQ08874 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MitfQ08874 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms