Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Siah2Q06986 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Siah2Q06986 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Siah2Q06986 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms