Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Fmn1Q05860 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Fmn1Q05860 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Fmn1Q05860 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Fmn1Q05860 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Fmn1Q05860 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms