Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Epha4Q03137 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Epha4Q03137 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Epha4Q03137 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms