Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gbp10Q000W5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gbp10Q000W5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gbp10Q000W5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms