Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pitx2P97474 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pitx2P97474 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pitx2P97474 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pitx2P97474 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms