Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Bop1P97452 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bop1P97452 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bop1P97452 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bop1P97452 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bop1P97452 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bop1P97452 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bop1P97452 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bop1P97452 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bop1P97452 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.8 ms