Protein–RNA interactions for Protein: P97291

Cdh8, Cadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh8P97291 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh8P97291 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh8P97291 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh8P97291 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh8P97291 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh8P97291 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh8P97291 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh8P97291 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh8P97291 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh8P97291 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh8P97291 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh8P97291 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh8P97291 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh8P97291 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh8P97291 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh8P97291 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh8P97291 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh8P97291 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh8P97291 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh8P97291 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh8P97291 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh8P97291 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms