Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frat1P70339 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Frat1P70339 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frat1P70339 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Frat1P70339 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Frat1P70339 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frat1P70339 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Frat1P70339 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Frat1P70339 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frat1P70339 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frat1P70339 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Frat1P70339 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms