Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Stra8P70278 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Stra8P70278 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Stra8P70278 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Stra8P70278 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Stra8P70278 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Stra8P70278 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Stra8P70278 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Stra8P70278 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Stra8P70278 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Stra8P70278 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Stra8P70278 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Stra8P70278 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Stra8P70278 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Stra8P70278 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms