Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tuba4aP68368 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tuba4aP68368 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tuba4aP68368 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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