Protein–RNA interactions for Protein: P63038

Hspd1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspd1P63038 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hspd1P63038 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hspd1P63038 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Hspd1P63038 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hspd1P63038 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hspd1P63038 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hspd1P63038 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hspd1P63038 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hspd1P63038 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hspd1P63038 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hspd1P63038 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hspd1P63038 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms