Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnrpfP62307 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnrpfP62307 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SnrpfP62307 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnrpfP62307 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms