Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga11P61622 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga11P61622 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga11P61622 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Itga11P61622 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga11P61622 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga11P61622 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga11P61622 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga11P61622 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga11P61622 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga11P61622 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga11P61622 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga11P61622 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga11P61622 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga11P61622 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms