Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PlnP61014 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PlnP61014 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PlnP61014 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PlnP61014 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PlnP61014 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PlnP61014 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PlnP61014 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PlnP61014 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PlnP61014 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PlnP61014 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PlnP61014 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PlnP61014 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PlnP61014 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PlnP61014 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PlnP61014 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PlnP61014 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PlnP61014 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PlnP61014 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PlnP61014 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PlnP61014 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PlnP61014 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PlnP61014 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PlnP61014 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PlnP61014 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PlnP61014 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PlnP61014 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PlnP61014 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PlnP61014 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PlnP61014 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PlnP61014 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PlnP61014 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PlnP61014 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PlnP61014 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PlnP61014 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PlnP61014 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PlnP61014 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PlnP61014 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PlnP61014 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PlnP61014 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PlnP61014 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PlnP61014 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PlnP61014 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PlnP61014 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PlnP61014 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PlnP61014 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PlnP61014 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PlnP61014 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PlnP61014 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PlnP61014 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PlnP61014 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PlnP61014 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PlnP61014 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PlnP61014 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PlnP61014 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PlnP61014 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PlnP61014 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PlnP61014 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PlnP61014 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PlnP61014 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PlnP61014 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PlnP61014 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PlnP61014 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PlnP61014 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PlnP61014 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PlnP61014 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PlnP61014 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PlnP61014 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PlnP61014 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PlnP61014 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PlnP61014 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PlnP61014 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PlnP61014 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PlnP61014 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PlnP61014 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PlnP61014 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PlnP61014 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PlnP61014 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PlnP61014 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PlnP61014 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PlnP61014 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PlnP61014 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PlnP61014 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PlnP61014 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PlnP61014 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PlnP61014 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PlnP61014 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PlnP61014 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PlnP61014 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PlnP61014 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PlnP61014 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PlnP61014 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PlnP61014 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PlnP61014 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PlnP61014 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PlnP61014 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PlnP61014 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PlnP61014 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PlnP61014 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PlnP61014 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.7 ms