Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fgd1P52734 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Fgd1P52734 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms