Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa6P50704 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa6P50704 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa6P50704 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa6P50704 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa6P50704 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa6P50704 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa6P50704 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa6P50704 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa6P50704 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa6P50704 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa6P50704 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa6P50704 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa6P50704 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa6P50704 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms