Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psen1P49769 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psen1P49769 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psen1P49769 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psen1P49769 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psen1P49769 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Psen1P49769 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psen1P49769 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen1P49769 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psen1P49769 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psen1P49769 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psen1P49769 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psen1P49769 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Psen1P49769 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.7 ms