Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tacr1P30548 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tacr1P30548 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tacr1P30548 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tacr1P30548 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tacr1P30548 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tacr1P30548 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tacr1P30548 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tacr1P30548 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms