Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
VtnP29788 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VtnP29788 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VtnP29788 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VtnP29788 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VtnP29788 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VtnP29788 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VtnP29788 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VtnP29788 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VtnP29788 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VtnP29788 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VtnP29788 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VtnP29788 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
VtnP29788 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VtnP29788 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VtnP29788 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VtnP29788 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VtnP29788 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VtnP29788 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
VtnP29788 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VtnP29788 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VtnP29788 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VtnP29788 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VtnP29788 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VtnP29788 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VtnP29788 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
VtnP29788 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VtnP29788 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VtnP29788 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VtnP29788 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VtnP29788 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VtnP29788 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VtnP29788 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VtnP29788 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VtnP29788 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VtnP29788 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VtnP29788 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VtnP29788 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VtnP29788 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VtnP29788 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VtnP29788 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VtnP29788 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VtnP29788 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VtnP29788 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VtnP29788 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VtnP29788 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VtnP29788 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VtnP29788 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VtnP29788 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VtnP29788 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VtnP29788 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VtnP29788 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VtnP29788 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VtnP29788 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VtnP29788 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VtnP29788 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VtnP29788 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VtnP29788 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VtnP29788 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VtnP29788 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VtnP29788 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VtnP29788 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VtnP29788 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VtnP29788 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VtnP29788 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VtnP29788 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VtnP29788 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VtnP29788 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VtnP29788 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VtnP29788 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VtnP29788 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VtnP29788 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VtnP29788 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VtnP29788 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VtnP29788 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VtnP29788 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VtnP29788 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VtnP29788 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VtnP29788 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VtnP29788 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VtnP29788 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms