Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa2P28309 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa2P28309 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa2P28309 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa2P28309 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa2P28309 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa2P28309 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa2P28309 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa2P28309 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa2P28309 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa2P28309 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa2P28309 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms