Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tpm3P21107 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tpm3P21107 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tpm3P21107 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.1 ms