Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxd4P10628 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxd4P10628 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms