Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem254aP0DN89 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem254aP0DN89 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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