Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Becn2P0DM65 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Becn2P0DM65 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Becn2P0DM65 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Becn2P0DM65 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms