Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NeflP08551 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NeflP08551 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NeflP08551 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NeflP08551 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NeflP08551 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NeflP08551 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NeflP08551 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NeflP08551 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NeflP08551 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NeflP08551 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NeflP08551 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NeflP08551 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NeflP08551 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NeflP08551 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NeflP08551 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NeflP08551 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NeflP08551 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NeflP08551 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NeflP08551 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NeflP08551 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NeflP08551 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NeflP08551 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NeflP08551 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NeflP08551 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NeflP08551 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NeflP08551 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NeflP08551 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NeflP08551 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NeflP08551 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NeflP08551 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NeflP08551 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NeflP08551 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NeflP08551 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NeflP08551 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NeflP08551 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NeflP08551 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NeflP08551 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NeflP08551 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NeflP08551 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NeflP08551 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NeflP08551 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NeflP08551 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NeflP08551 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NeflP08551 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NeflP08551 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NeflP08551 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NeflP08551 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NeflP08551 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NeflP08551 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NeflP08551 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NeflP08551 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NeflP08551 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NeflP08551 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NeflP08551 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NeflP08551 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NeflP08551 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NeflP08551 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NeflP08551 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NeflP08551 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NeflP08551 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NeflP08551 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NeflP08551 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NeflP08551 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NeflP08551 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NeflP08551 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NeflP08551 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NeflP08551 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NeflP08551 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NeflP08551 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NeflP08551 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NeflP08551 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NeflP08551 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NeflP08551 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NeflP08551 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NeflP08551 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NeflP08551 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NeflP08551 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NeflP08551 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NeflP08551 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NeflP08551 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NeflP08551 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NeflP08551 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NeflP08551 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NeflP08551 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NeflP08551 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NeflP08551 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NeflP08551 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NeflP08551 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NeflP08551 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NeflP08551 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NeflP08551 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NeflP08551 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NeflP08551 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NeflP08551 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NeflP08551 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NeflP08551 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NeflP08551 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NeflP08551 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NeflP08551 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.4 ms