Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P01679 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01679 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01679 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
P01679 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01679 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P01679 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01679 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
P01679 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
P01679 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01679 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01679 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01679 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P01679 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
P01679 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01679 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01679 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01679 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01679 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01679 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01679 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01679 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01679 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01679 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01679 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01679 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01679 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01679 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01679 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01679 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01679 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01679 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01679 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01679 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01679 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01679 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01679 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01679 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01679 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01679 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01679 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01679 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01679 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01679 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01679 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01679 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01679 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01679 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
P01679 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01679 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01679 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01679 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01679 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01679 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01679 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
P01679 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01679 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01679 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01679 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01679 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01679 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01679 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01679 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01679 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01679 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01679 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01679 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01679 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01679 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01679 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01679 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01679 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01679 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01679 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01679 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01679 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01679 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01679 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01679 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01679 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01679 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01679 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01679 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01679 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01679 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01679 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01679 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01679 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01679 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01679 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01679 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01679 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01679 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P01679 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P01679 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P01679 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
P01679 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01679 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01679 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01679 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms