Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ShdO88834 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ShdO88834 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ShdO88834 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ShdO88834 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ShdO88834 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ShdO88834 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ShdO88834 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ShdO88834 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ShdO88834 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ShdO88834 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ShdO88834 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ShdO88834 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ShdO88834 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ShdO88834 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ShdO88834 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ShdO88834 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ShdO88834 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ShdO88834 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ShdO88834 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ShdO88834 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ShdO88834 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ShdO88834 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ShdO88834 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ShdO88834 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ShdO88834 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ShdO88834 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ShdO88834 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ShdO88834 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ShdO88834 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ShdO88834 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ShdO88834 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ShdO88834 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ShdO88834 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ShdO88834 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ShdO88834 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ShdO88834 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ShdO88834 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ShdO88834 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ShdO88834 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ShdO88834 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ShdO88834 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ShdO88834 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ShdO88834 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ShdO88834 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ShdO88834 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ShdO88834 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ShdO88834 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ShdO88834 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ShdO88834 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ShdO88834 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ShdO88834 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ShdO88834 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ShdO88834 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ShdO88834 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ShdO88834 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ShdO88834 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ShdO88834 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ShdO88834 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ShdO88834 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ShdO88834 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ShdO88834 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ShdO88834 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ShdO88834 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ShdO88834 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ShdO88834 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ShdO88834 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ShdO88834 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ShdO88834 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ShdO88834 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ShdO88834 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ShdO88834 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ShdO88834 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ShdO88834 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ShdO88834 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ShdO88834 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ShdO88834 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ShdO88834 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ShdO88834 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ShdO88834 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ShdO88834 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ShdO88834 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ShdO88834 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ShdO88834 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ShdO88834 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ShdO88834 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ShdO88834 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ShdO88834 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ShdO88834 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ShdO88834 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ShdO88834 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ShdO88834 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ShdO88834 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ShdO88834 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ShdO88834 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ShdO88834 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ShdO88834 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ShdO88834 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ShdO88834 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ShdO88834 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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