Protein–RNA interactions for Protein: O88573

Aff1, AF4/FMR2 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff1O88573 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aff1O88573 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aff1O88573 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aff1O88573 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aff1O88573 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aff1O88573 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aff1O88573 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aff1O88573 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aff1O88573 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aff1O88573 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aff1O88573 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aff1O88573 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aff1O88573 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aff1O88573 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms