Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stra6O70491 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stra6O70491 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra6O70491 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stra6O70491 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stra6O70491 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stra6O70491 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Stra6O70491 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stra6O70491 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stra6O70491 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stra6O70491 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stra6O70491 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Stra6O70491 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stra6O70491 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stra6O70491 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stra6O70491 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stra6O70491 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stra6O70491 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stra6O70491 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stra6O70491 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stra6O70491 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stra6O70491 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stra6O70491 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stra6O70491 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stra6O70491 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Stra6O70491 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stra6O70491 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stra6O70491 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms