Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp8O70404 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp8O70404 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp8O70404 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp8O70404 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp8O70404 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp8O70404 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp8O70404 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp8O70404 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp8O70404 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp8O70404 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp8O70404 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp8O70404 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp8O70404 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp8O70404 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp8O70404 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp8O70404 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp8O70404 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp8O70404 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp8O70404 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp8O70404 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp8O70404 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp8O70404 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp8O70404 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp8O70404 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp8O70404 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp8O70404 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp8O70404 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp8O70404 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp8O70404 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp8O70404 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp8O70404 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp8O70404 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms