Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pja1O55176 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pja1O55176 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pja1O55176 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pja1O55176 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pja1O55176 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pja1O55176 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pja1O55176 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pja1O55176 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pja1O55176 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pja1O55176 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pja1O55176 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pja1O55176 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pja1O55176 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pja1O55176 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms