Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bnc1O35914 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bnc1O35914 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms