Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bhlhe40O35185 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Bhlhe40O35185 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Bhlhe40O35185 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms