Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Kcns1O35173 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcns1O35173 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcns1O35173 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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