Protein–RNA interactions for Protein: J3QP80

Gm5814, MCG15559, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5814J3QP80 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5814J3QP80 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5814J3QP80 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5814J3QP80 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5814J3QP80 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5814J3QP80 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5814J3QP80 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5814J3QP80 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm5814J3QP80 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5814J3QP80 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5814J3QP80 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5814J3QP80 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5814J3QP80 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5814J3QP80 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5814J3QP80 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5814J3QP80 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5814J3QP80 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5814J3QP80 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5814J3QP80 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm5814J3QP80 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm5814J3QP80 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm5814J3QP80 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms