Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm5294J3QP53 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm5294J3QP53 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm5294J3QP53 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm5294J3QP53 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm5294J3QP53 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms