Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm20795J3QP49 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm20795J3QP49 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm20795J3QP49 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Gm20795J3QP49 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gm20795J3QP49 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gm20795J3QP49 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gm20795J3QP49 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20795J3QP49 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20795J3QP49 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Gm20795J3QP49 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20795J3QP49 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Gm20795J3QP49 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm20795J3QP49 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20795J3QP49 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20795J3QP49 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20795J3QP49 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm20795J3QP49 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20795J3QP49 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20795J3QP49 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20795J3QP49 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm20795J3QP49 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20795J3QP49 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20795J3QP49 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20795J3QP49 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20795J3QP49 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm20795J3QP49 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20795J3QP49 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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